Если проверены все узлы, могущие быть причиной проблемы, то, возможно, дело именно в замене резины. Старая, со стертым протектором, имела форму близкую к прямоугольнику ( грубо говоря ), а новая как раз ровненький полукруг. Соответственно точка контакта резины с дорогой стала поменьше, сместить ее проще и с непривычки немного колбасит. Это из серии танцев с бубном, но не один раз сталкивался с подобным.